学术查重系统引用文献筛选策略主要包括手动筛选和自动筛选两种方法。手动筛选需要逐篇文献进行人工核对，而自动筛选则利用软件工具进行快速识别和比对。手动筛选的优点是精准度高，适用于少量文献的查重；自动筛选则适用于大规模文献查重，能够提高效率。在实际应用中，可以根据具体的需求和文献量选择合适的筛选策略。

此外，在进行学术查重系统引用文献筛选时，还需要注意文献的来源、年代、重要性等因素。针对不同学科领域，筛选策略也会有所不同。在实际操作中，可以结合软件工具和专业知识，制定灵活有效的筛选策略，确保查重工作的准确性和高效性。